大棚栽培黄瓜由于受区域专业化生产、种植习惯和技能等条件的限制，黄瓜连作非常普遍，非常容易引起各种营养性障害及各种病虫害，生产上要采取综合防治措施。
1 黄瓜缺磷症
1.1 症状
一般缺磷时植株矮化但不明显，植株生长受阻，茎短而细，叶片小，叶色浓绿，叶片发硬，稍微向上挺；老叶有明显的暗红色斑块，有时斑点变褐色，下位叶片易脱落；须根发育不良；果实小，成熟晚。
1.2 防治措施
黄瓜是对磷非常敏感的作物，土壤缺磷时，除了施用磷肥外，预先要培肥土壤。苗期特别需要磷，应注意增施磷肥。为防止土壤酸化，要施用充足的堆肥等有机肥料。施用堆肥后，磷酸根离子不会直接与土壤接触，可减少被铁、铝结合的机会，对磷的吸收很有利。应急措施：叶面喷施磷酸二氢钾溶液。
2 细菌性角斑病
2.1 症状
真叶发病初期出现针尖大小水渍状浅绿色斑点，迅速扩大为淡褐色病斑，受叶脉限制而呈多角形。潮湿时，病斑背面水渍状明显，有时可见到有乳白色菌脓。此病连接成片时可形成多角形的破损面。本病与霜霉病的区别是角斑病病斑颜色较浅、发白，后期穿孔，叶背面无霉毛，有白色粘液；霜霉病病叶病斑有黑色或紫色霉层，病斑不减薄，后期不穿孔。茎蔓发病，初为水渍状小圆点，后变为淡褐色。
2.2 防治方法
防治细菌性角斑病要以防为主，当平均日气温 12℃低于时，连续 2~3 天阴雨，突击用药 1 次，隔 3~5 天再用药 1 次，连续 2~3 次，可控制发生。
2.2.1 种子消毒：用 50%菌成 1000 倍液浸种 6 小时，捞出种子浸入清水中 3 小时后催芽播种。
2.2.2 采用无病土育苗：与非瓜类作物进行轮作，防止重茬，田间随时清除病叶并深埋。
2.2.3 药剂防治：可用 30%DT 杀菌剂可湿性粉剂 400~500 倍液、50%1000 倍药液的甲基托布津、可杀得等综合防治，效果良好。冬季发病严重时，用医用硫酸链霉素和青霉素，5 千克水中各加 1 支。
3 炭疽病
3.1 症状
茎、叶片受害，初出现水浸状小斑点，后扩大成圆形病斑，红褐色，外围有一圈黄纹。潮湿时病斑中央出现粉红色粘稠物，干燥时病斑开裂，瓜条从病部弯曲或畸形。
3.2 防治方法
3.2.1 土壤处理：与非瓜类作物实行 3 年以上的轮作
苗土可用无病大田土，或进行土壤消毒，用菌线威，0.3~0.5 克/平方米对水 5000 倍，均匀喷洒在苗床土面。
3.2.2 药剂防治：发病初期用天诺颗粒丰杀菌型对水1000 倍喷洒植株，或 70%代森锰锌可湿性粉剂 600~800倍液，或 58%甲霜灵锰锌可湿性粉剂 500~600 倍液喷雾。
4 根结线虫病
4.1 症状
受害植株的侧根和须根上长有奇形怪状或念珠状的根结。根结是局部膨大而成的，初期多为白色，后期变成淡褐色甚至黑色，有的上面长有细弱的新根，严重时就成为一团团须根，中间夹杂着根结，剖开根结，其中藏有乳白色线虫。
4.2 防治方法
4.2.1 培育无毒壮苗：一是用无病原的土进行育苗；二是采用物理方法提前处理床土。
4.2.2 高温处理：利用线虫在 55℃下只要 5 分钟就可以致死的特点，采用夏季撒石灰、铺稻草、淹水、覆膜的方法进行处理，或用开水逐畦浇灌将其杀死。
4.2.3 深翻：利用根线虫主要分布在 3~9 厘米的表层土中的特点，深翻或起出 20 厘米耕层土，可减轻危害。
4.2.4 实行计划轮作：实行与黄瓜远缘作物如韭菜 2~3年轮作，就可以断绝线虫的食源，使其无法生存。
4.2.5 灌施药剂法：施用底肥，2 次深翻将粪土与土充分混匀，耧平。用 1.8%齐螨素乳油 6.0~7.5 升/公顷，将其与 375 千克/公顷细沙土拌匀，然后均匀撒布地面，深翻8~12 厘米，耧平。定植后用 80%敌敌畏乳油 800~1000倍液，每株喷洒 250 毫升。