一、存在问题
1.畜牧兽医行业人员身体健康存在隐患
从动物饲养到屠宰，中间有很多环节，每个环节都需要畜牧兽医行业人员的参与。但是在众多环节中，很多兽医行业人员没有医院出示的身体健康证明，存在安全隐患。如果饲养环节的行业人员患有人畜共患的疾病，就很有可能将疾病传播给动物。在动物屠宰过程中，很有可能传播给已经检疫过的动物肉产品上，这样的肉制品就存在潜在病毒危险，造成人畜共患病的传播。
2.市民追求新鲜肉制品
随着人们生活质量的提高，对于很多家禽，人们更多的是选择新鲜的肉产品，而不是购买经过检疫的合格肉产品。出现了现买现杀的场景，很多市民在菜市场上选择鲜活的家禽，通过现场宰杀来保证肉产品的绝对新鲜。但是很多市场上的家禽未经过动物检疫部门的检疫，存在安全隐患。而且农贸市场人流量大，屠宰家禽时羽毛乱飞，污水乱排，很容易造成人畜共患病的传播。
3.污染治理基础设施建设滞后
我国从事畜牧养殖者众多，每年国家投入资金不足，再加上相关政府部门没有给予足够重视，监督不到位，屠宰场和畜产品加工单位只重视眼前经济利益，而没有投入资金来建立完善的污染治理基础设施，导致我国在畜牧兽医污染治理基础设施滞后。
二、带来的危害
1.严重威胁国民的身体健康
由于我国畜牧养殖的污染治理基础设施差，对畜禽的粪便及污水不能进行很好的处理，污染物直接排入河里，严重的影响水质，直接威胁身体健康。畜禽产品存在安全隐患，人们食用后存在潜在的危险，间接的威胁身体健康。
2.增加了重大动物疫病防控工作的难度
近年来，不断的出现高致病性禽流感等重大的动物疫情，暴发的养殖场大多是污染严重、管理不善导致的。我国在重大动物疫病防控工作上每年都在加大力度，但是由于很多养殖场卫生状况恶劣，给疫病防控工作带来了很大的的难度。
3.给我国畜禽产品进军国际市场带来压力
当前畜牧养殖的畜禽产品已经满足国内市场的消费，甚至出现畜禽产品的过剩，进军国际市场成为迫在眉睫的问题，但是由于以前出口的畜禽产品因有毒有害而被很多国外市场拒绝。我国正在努力的改变现状，但是由于在畜牧兽医卫生存在诸多问题，导致产品的质量也存在安全问题，给我国畜禽产品进军国际市场带来巨大压力。
4.阻碍环保型社会和社会主义新农村建设
当前国家大力提倡建设环保型社会和社会主义新农村，但是我国的畜牧兽医卫生存在很多问题，尤其是环境污染严重，与建设环保型社会和社会主义新农村的要求完全不合，严重的影响环保型社会和社会主义新农村建设的步伐。
三、对策
1.规范化对畜禽屠宰和肉制品加工
首先政府要实施相关的保障措施，对于不合格的屠宰场严厉打击。并通过相关政策逐步的取消小型屠宰场，建立大型的、安全的机械化屠宰场，并禁止在农贸市场进行现场宰杀交易。同时要对市民宣传，提高市民的卫生防疫意识，购买经过动物检疫部门检疫过的畜禽产品，不要现买现杀。
2.规范化养殖
地方政府要根据当地特点，对畜牧养殖集中化，统一划分土地，建立养殖区。养殖区的统一规划有利于管理，能够有效的对疫病进行防治，为改善畜牧兽医卫生状况打下坚实的基础。
3.政府加大对畜牧业扶持力度
各级政府每年要有专门的资金用于畜牧业扶持，通过对污染治理基础设施的建设，极大的改善畜牧兽医卫生现状，避免了环境污染。同时可以利用产生的粪便进行沼气发酵，沼气可以为养殖户提供能源，发酵的残渣还可以作为农用肥料，符合我国环保型社会和社会主义新农村建设要求。
4.加强相关的法律法规宣传力度
我国畜牧兽医卫生很多问题的根源在于人们对畜牧兽医卫生认识不足，可通过不同的形式对《中华人民共和国动物防疫法》（以下简称《动物防疫法》）、《动物防疫条件审核管理办法》等相关的法律法规进行广泛的宣传，使得人们认识到畜牧兽医卫生的重要性。同时要对一切与畜牧相关的人员培训教育，让其认真学习相关的法律法规，并严格按照相关规定和法律法规进行作业。
四、结语
畜牧兽医卫生问题对畜牧养殖业的发展危害极大，如不及时的采取有效措施将会给畜牧养殖带来严重影响。近年来，随着人们对卫生防疫意识加强，未来的畜牧养殖业中，相关的人员严格执行《动物防疫法》、《动物防疫条件审核管理办法》等相关的法律法，再加上政府对畜牧兽医卫生的重视和加大对污染治理基础实施的投入建设，畜牧兽医卫生条件不断的改善，为我国的畜牧养殖业打开新的局面。